在希腊古典哲学中，德谟克利特就提出了它著名的原子论，认为这个宇宙是由一些不可分割的原子组成的，这也是这一名词继续被粒子物理学家沿用的原因。而随着上个世纪粒子物理的发展，特别是量子电动力学和色动力学的发展，人们对基本粒子的认识可谓渐趋完善。物理学家普遍认为自然界存在4种基本相互作用力，由玻色子传递作用力，而所有粒子由轻子和夸克组成。夸克之间通过胶子传递强相互作用力，由正负夸克组成介子，由三种色荷的夸克可以组成重子。我们日常生活中所接触到的化学元素都是由重子和轻子组成的。而标准粒子模型也提出奇异夸克可以存在，也就是超过三个夸克的重子可以存在，但是目前尚存争论。然而，不可思议的是夸克不能单独存在。也就是说，夸克只能被禁闭在重子和介子内部。当强子对撞机试图通过高能碰撞将单个夸克从重子中分离出来的时候，这些能量被胶子吸收产生了正反夸克对，并以胶子的形式被探测到，而重子仍然没有改变。这种奇特的现象就是所谓的夸克禁闭。而根据所谓的渐近自由的理论，夸克之间的距离越近，它们所受的力就越小，就越自由。而当外力试图将其中一个夸克分离出去的时候，夸克之间的作用力会非常强，以至于可以产生新的夸克来补偿分离出去的夸克。
这种奇特的物理现象可以用来很好的类比上帝自己的三位一体属性。如同三位一体由三个位格组成，同样，重子粒子也由三个夸克组成。正如三个位格不可分离，不可混淆，同样，三个夸克也有不同色荷，却不可分离。如同三个位格有同样的神性本质，同样，三个夸克也有同样的本质。三位一体的教义源于圣经，但此教义的形成得益于阿塔拿修的辩护，其结果，乃是阿塔拿修信经的形成。其中关于三位一体的描述是：父一位，子一位，圣灵亦一位。然而父子圣灵同一神性，同一荣耀，亦同一永恒之尊严。父如何，子如何，圣灵亦如何。父不受造，子不受造，圣灵亦不受造。父无限，子无限，圣灵亦无限。父永恒，子永恒，圣灵亦永恒。非三永恒者，乃一永恒者。非三不受造者，非三无限者，乃一不受造者，一无限者。如此，父全能，子全能，圣灵亦全能。然而，非三全能者，乃一全能者。如是，父是神，子是神，圣灵亦是神。然而，非三神，乃一神。如是，父是主，子是主，圣灵亦是主。然而，非三主，乃一主。依基督真道，我等不得不认三位均为神，均为主。依大公教，我等亦不得谓神有三，亦不得谓主有三。父非由谁作成：既非受造，亦非受生。子独由于父：非作成，亦非受造；而为受生。圣灵由于父和子：既非作成，亦非受造，亦非受生；而为发出。如是，有一父，非三父，有一子，非三子，有一圣灵，非三圣。且此三位无分先后，无别尊卑。三位乃均永恒，而同等。
如果我们将三位一体的教义和粒子物理关于夸克禁闭的描述进行对比，我们就会发现它们惊人的相似。所以，上帝无疑在祂的创造当中彰显了祂三位一体的神性本质。
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