虽然很多的神学家善于调和自然科学和圣经之间的表面矛盾或者发现圣经与自然科学以及数学之间的和谐关系，但是这个时代缺乏的是一些善于发现某些圣经原则并用于发展当今自然科学的神学家和科学家。如果我们有一批很好的神学家和很认真很专业的科学家合作，那么我想圣经当中的思想对当今科学的影响是不可估量的。当很多基督徒对自然科学的认识仍然停留在进化论和经典物理的水准的时候，科学家们已经开始探讨新的问题了，这些问题不再只是自然现象中的规律而已。这些新的探索已经开始敲开哲学和宗教紧闭的大门。比如，现在的科学研究已经不再局限于对细胞和器官组织如何运作的研究，而是开始用进化的思想和生物信息的思想来探索疾病，死亡和生命的成因。而且现在生命起源的研究已然是一门前沿科学，是生物，天文，化学和地球科学等多个学科门类共同研究的热门课题。不仅如此，人们已经在量子科学里面发现了经典逻辑所无法解释的现象，所以，现在有一批物理学家所从事的研究是设计实验来检验传统逻辑，哲学和世界观的正确性。如果基督教思想家只是一味地去努力地调和或者欣赏那些经典的科学理论，最终我们可能会发现这种努力始终是过时的。虽然很多的护教学者声称不再为“缝隙中的上帝”辩护，但是对于无神论者而言，这些护教学家就是在为“缝隙中的上帝”辩护，为什么呢？一个明显的例子就是宇宙的精细调节问题。对于基督徒而言，这是一个上帝创造适合人类居住的宇宙的最佳证明，但是对于无神论科学家而言，这只是意味着还有更好的理论来解释这个宇宙的起源。对于这些科学家而言，通过精细调节问题来证明上帝的存在就是在找科学的漏洞，就是在证明缝隙中的上帝。当然我们也没有必要迎合无神论者的观点，正如RTB的创始人Hugh Ross所言，如果精细调节问题慢慢被解决了，那么就证明这种精细调节的论据是不对的；如果精细调节问题越来越棘手，那么就证明这确实是上帝的作为。而这样一种模型验证显然有点模糊不清。比如如何定义精细调节，有的人说这些参数是精细调节的，有的人说那些，有的人干脆说没有任何参数是基本的。所以，如果科学家基督徒要发展本于圣经的科学模型，一方面得了解当今科学的前沿课题（state of the art），另一方面得明白圣经的思想如何切入到这些研究当中。根据我自己的经验，我想分享一些重要的圣经思想以及如何用于建立科学模型。
第一，人是由灵魂和身体组成的。这种二元论的思想不仅在圣经中启示，而且也启示在一般的哲学和宗教思想当中。所以，我们在各个文化当中都观察到这种思想的存在。那么，这种灵体二元的思想如何切入到当今的生物学研究当中呢？如何为灵魂建立一个科学模型呢？既然灵魂是属于灵界的，那么我们又如何在物质界探测到它的存在呢?既然灵魂是无法探测的，我们又如何来用它建立一个科学模型呢？这些问题实在都是很棘手的问题。但是，我要说的是，科学模型中的很多参数都不是那么容易定义的，因为它们不能很直观地对应于物体的某些状态。比如对能量的定义就很曲折，最开始人们认识到热是一种能量，为了解释热能，人们使用了燃素这个概念来量化热。但是，后来人们发现摩擦生热不能用燃素来解释，于是人们慢慢认识到燃素并不存在，热能只是一种能量形式，它可以和机械能相互转化。最后人们意识到能量不仅包括机械能，势能和热能，还包括物体的化学能乃至静止质量。当今对能量的认识已经更加深入，甚至认为真空由于充满了量子涨落，所以它也是一种能量的形式，甚至这种能量很可能是导致宇宙加速膨胀的原因。所以，我们可以看到，虽然能量可以有很多表现形式，但是我们不能直观地去观察它。那么灵魂是否也是如此呢？我认为灵魂对于人体的作用和能量对于物理世界的作用很相似。灵魂虽然不能被探测，但是它每时每刻都在藉着人体产生作用。所以，与Paul Davies的观点不一样（他在和Hugh Ross的辩论中认为上帝不应该具有人那样的位格，因为上帝是超越的），我认为人的灵魂的价值远超越于物质世界的价值，人的灵魂本身就是最有价值的存在，是整个宇宙的焦点。
那么到底该如何给灵魂建立一个模型呢？按照我之前博文中所描述的，我们可以用一种类似计算机软件和硬件之间的关系来模拟灵魂和肉体的相互作用。正如软件的作用是给电脑输入命令并让电脑执行命令，同样灵魂也支配肉体并让肉体产生行动。但是这两者并不是那么独立的。正如电脑的硬件必须运转正常而且必须支持软件的语言和精度要求，同样，身体也必须拥有相应的结构和基因来容许灵魂将其支配。正如软件可以离开硬件而依然以另外的形式存在，同样灵魂也可以离开身体以另外的形式存在（比如耶稣复活之后的身体）。如果我们要用这种计算机模型来类比地模拟人的灵魂和肉体的关系，我们就必须进一步去了解灵魂是怎样储存的（如何建立在大脑的记忆中的），灵魂的语言是如何被肉体识别的（或者它的驱动和借口是什么），灵魂又是如何自我更新的（如同软件更新一样）等。记住，这里对灵魂的建模并不代表我们真正明白灵魂是什么，正如我们知道万有引力的公式并不代表我们知道引力本身是什么一样。所以，虽然我们不能彻底地明白灵魂本身是什么，但是我们可以明白它是如何运作的，如何和身体纠缠的。我们可以进一步比较这种二元论的模型（物质和灵魂）和一元论模型（只有物质）的优劣，并进而促进更多的科学研究。
第二，神用话语创造并护理整个宇宙。我觉得这个最普通的圣经原则也是最被人忽略的深刻思想。我们知道这话语是与基督联系在一起，或者说就是基督，我们也发现圣经启示万有都是本于祂，依靠祂，并归于祂。而祂就是道。所以更大胆的说，祂就是这个宇宙的灵魂，这和上一个圣经思想紧密关联。不过，我并没有深入研究基督论，若要继续探究下去，恐怕陷入异端的思想。但我要坚持的是，这个宇宙的根基在于上帝的话语，无论是它的被造，还是它现在的运行，都在于上帝的话语。这话语表现在诸多的科学研究中，比如精细调节问题，太阳系起源问题，生命起源问题，DNA信息等。而现在的量子物理最前沿的研究就是量子信息，所以，这话语很可能是借着量子系统表达出来的，因为我们已经发现了量子可以像电子一样用于计算。这种话语控制物理世界不是和人的灵魂控制身体很相似吗？这种思想并不是泛神论，因为它截然区分了信息和物质，灵魂和肉体。那么我们该如何描述上帝的话语呢？如何建立模型呢？这也是我想发展的一个研究方向。
首先，我们要识别哪种结构里面可能有上帝创世的信息。比如地球产生的初始条件中可能有上帝话语的输入。其次，我们要研究这种信息怎样地透过量子系统放大到宏观系统。量子信息只存在于量子耦合的系统中，一旦量子系统与经典系统接触，量子信息要么被抹去，要么被读取并且放大为一种初始条件（比如量子计算机运算结果的输出）。所以，研究这种信息从量子系统到经典系统的转变是问题的关键。然后，我们要知道如此微小的量子信息该如何放大到宏观乃至宇观世界。正如DNA信息可以表达出一个生命系统，同样，上帝信息如何表达出一个宇观结构呢？我觉得一个很可能的机制就是相变。只有在相变的过程中，微观的信息才可能发展成宏观的初始条件。最后，这种宏观的初始条件经过一系列的非线性过程发展出宇观的结构。当然，上帝除了可以借用量子系统来输入信息，祂也可以借用混沌现象来输入信息。动力学混沌现象就是系统的输出非常敏感于系统的输入，哪怕这种输入变动非常的微小，也会导致结果谬以千里（著名的蝴蝶效应）。
但也许你要问，为什么上帝要输入这些微观的信息，而不直接创造一个太阳系呢？我认为原因至少有两个。第一，祂要人去了解祂创造的一切，正如祂让亚当给动物命名一样。只有人去探索万物运行的原理，人才能治理万物。而如果上帝直接而且频繁地超自然地不藉着手段地介入到这个宇宙，我们就难以认识它和治理它。第二，祂要隐藏在这个罪恶的世界背后。上帝是圣洁的，所以我们在这个世界中无法察觉祂直接的干预（除非是祂用于救赎目的的神迹）。按照圣经的说法就是，我们是在死荫的幽谷中，除了圣经，没有从自然而来的特殊启示。值得注意的是，如同上帝创造时的话语可以在自然的结构中去探索以外，上帝护理的话语（即用祂权能的命令托住万有）也可以用类似的方式去了解。然而，也许我们最终并不能弄清楚上帝到底说了什么话，如同破解计算机密码一样。但是，我们需要明白的是这个宇宙肯定有信息的输入，而这种信息不是宇宙和物理定律本身所能解释的。注意，这并不是另一个“缝隙中的上帝”的论据，因为这种信息宇宙的模型本身就是基于上帝用话语创世的思想，所以，直接验证了圣经思想的真确性。于是，我们不再自下而上地去论证哪种自然现象可能是上帝做的，而是自上而下地预言哪些现象是上帝话语的宏观表现。
第三，这个宇宙是为了道成肉身的基督而存在。圣经说，万有都是本于祂，依靠祂，并且归于祂。这就表明，这个宇宙存在的终极原因是为了基督，具体而言，就是为了基督道成肉身。因为只有基督是神本体的真像，只有基督的道成肉身完美地彰显了上帝的荣耀。一旦我们知道这个宇宙的终极目的，我们就可以进一步去追问一些自然现象的终极原因，同时也为探索宇宙的运作方式提供了重要线索。正如一个建筑师在建造房屋之前会画图纸，同样上帝也按照祂的道成肉身的救恩蓝图去建造宇宙。正如我在前面一篇博文中谈到的，如果我们以道成肉身作为第一公理，我们就可能推导出为什么这个宇宙是这样子的，而不是别样的。正如莱布尼兹所言，这个宇宙是上帝所创造最好的宇宙。为什么有死亡和自然灾难呢，因为没有死亡和灾难我们不知道罪的结果，也就不明白基督受难的必要性和重要性。为什么量子世界有不确定性呢？因为道成肉身的宇宙必然是一个罪恶的世界，所以，这个罪恶的世界必然有一种机制允许上帝继续护理，但同时又不与罪人相交。我们可以运用同样的逻辑去追问更多的自然和人文现象。所以，基督的道成肉身可以称为这个宇宙的第一公理。一旦这个模型得以建立，我们不仅可以去解释宇宙现象存在的必要性，也可以去解释物理定律的必需性并建立一些模型去预言一些现象。比如我们明白死亡是道成肉身的必需，我们就可以预言科学无法解决死亡的问题，死亡根深蒂固地根植于人的身体中。这种预言虽然是负面的，但是我们可以由这种思想继续探索哪些人体的构造或者基因导致了死亡的必然性。正如爱因斯坦假设光速是恒定的，进而推导出狭义相对论；同样，我们也可以假定死亡是必然的，进而推导出生物学的定律。
第四，这个宇宙中存在某种指向天堂的结构。在上一个思想中，我们看到这个世界的构造是人犯罪的一种表现，也就是说，这个宇宙本来可以不用这样的，但是为了容许人犯罪并且基督道成肉身，这个宇宙就被造成这样了。但是这个宇宙也同样地在盼望一个更美的世界，这就是罗马书所言的，“被造之物都热切盼望，热切等待着神的儿女显现出来……我们知道，所有被造之物都一同呻吟、同受阵痛，直到如今”。是的，它们在叹息，但是它们同时也在盼望，因为上帝在第七天进入了祂的安息，而且按照圣经神学的说法，天堂一直以喻体的形式被我们认识，最开始是伊甸园，后来是约柜，后来是会幕，圣殿，最后是基督，教会，最终是荣耀的天堂，和上帝同在的地方。那么在这个宇宙中必然也设立了某种次序，这种次序让我们看到将来的荣耀。安息日很可能不只是一种上帝给人的一种任意的规定，而是上帝设立在受造之物当中的一种时间次序。也就是说，上帝设立了两种次序，一种是以七为标准的时间次序，另外一种是以地球为标准的空间次序。只有这样去设想，我们似乎才能想得明白为什么受造之物也在叹息和盼望。而且，上帝不仅让人守安息日，也让地守安息日。不仅如此，上帝也将7视为完全数。也就是说，这种次序甚至存在于数学当中。当然，这些都是需要继续研究并探索的思想。我可以设想的一个应用就是热力学第二定律。其实，热力学第二定律本身是从微观世界涌现出来的一个定律，这个定律告诉我们一切的秩序都将变为混乱无序，生命将变为死亡，但是天堂并没有热力学第二定律，否则天堂也有死亡了。那么如何克服热力学第二定律呢？麦克斯维前瞻性地提出麦克斯维妖来解决这一问题。只要有一个精灵可以探测粒子的信息而对其进行分类，那就可以克服热力学第二定律。也就是说，热力学第二定律中的熵和信息具有某种等价性，获取信息就可以阻止熵增，进而克服热力学第二定律。所以，我想上帝的话语正是克服热力学第二定律的最好选择，因为正是由于这种信息，我们才看到了结构，生命和希望。所以，基督说，祂的话就是生命，这一点也不是类比，而是事实。
我想也许有更多的圣经原则有待我们去发现和运用。神的话语不断更新我们的生命，也不断震撼我们的头脑。我们并不必去发明新的教义，而是圣灵可以藉着那古旧的启示来更新我们的生命，来拓展祂的国度。愿我们都进入那上帝的国与安息中！
两本书 