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虽然很多的神学家善于调和自然科学和圣经之间的表面矛盾或者发现圣经与自然科学以及数学之间的和谐关系，但是这个时代缺乏的是一些善于发现某些圣经原则并用于发展当今自然科学的神学家和科学家。如果我们有一批很好的神学家和很认真很专业的科学家合作，那么我想圣经当中的思想对当今科学的影响是不可估量的。当很多基督徒对自然科学的认识仍然停留在进化论和经典物理的水准的时候，科学家们已经开始探讨新的问题了，这些问题不再只是自然现象中的规律而已。这些新的探索已经开始敲开哲学和宗教紧闭的大门。比如，现在的科学研究已经不再局限于对细胞和器官组织如何运作的研究，而是开始用进化的思想和生物信息的思想来探索疾病，死亡和生命的成因。而且现在生命起源的研究已然是一门前沿科学，是生物，天文，化学和地球科学等多个学科门类共同研究的热门课题。不仅如此，人们已经在量子科学里面发现了经典逻辑所无法解释的现象，所以，现在有一批物理学家所从事的研究是设计实验来检验传统逻辑，哲学和世界观的正确性。如果基督教思想家只是一味地去努力地调和或者欣赏那些经典的科学理论，最终我们可能会发现这种努力始终是过时的。虽然很多的护教学者声称不再为“缝隙中的上帝”辩护，但是对于无神论者而言，这些护教学家就是在为“缝隙中的上帝”辩护，为什么呢？一个明显的例子就是宇宙的精细调节问题。对于基督徒而言，这是一个上帝创造适合人类居住的宇宙的最佳证明，但是对于无神论科学家而言，这只是意味着还有更好的理论来解释这个宇宙的起源。对于这些科学家而言，通过精细调节问题来证明上帝的存在就是在找科学的漏洞，就是在证明缝隙中的上帝。当然我们也没有必要迎合无神论者的观点，正如RTB的创始人Hugh Ross所言，如果精细调节问题慢慢被解决了，那么就证明这种精细调节的论据是不对的；如果精细调节问题越来越棘手，那么就证明这确实是上帝的作为。而这样一种模型验证显然有点模糊不清。比如如何定义精细调节，有的人说这些参数是精细调节的，有的人说那些，有的人干脆说没有任何参数是基本的。所以，如果科学家基督徒要发展本于圣经的科学模型，一方面得了解当今科学的前沿课题（state of the art），另一方面得明白圣经的思想如何切入到这些研究当中。根据我自己的经验，我想分享一些重要的圣经思想以及如何用于建立科学模型。

第一，人是由灵魂和身体组成的。这种二元论的思想不仅在圣经中启示，而且也启示在一般的哲学和宗教思想当中。所以，我们在各个文化当中都观察到这种思想的存在。那么，这种灵体二元的思想如何切入到当今的生物学研究当中呢？如何为灵魂建立一个科学模型呢？既然灵魂是属于灵界的，那么我们又如何在物质界探测到它的存在呢?既然灵魂是无法探测的，我们又如何来用它建立一个科学模型呢？这些问题实在都是很棘手的问题。但是，我要说的是，科学模型中的很多参数都不是那么容易定义的，因为它们不能很直观地对应于物体的某些状态。比如对能量的定义就很曲折，最开始人们认识到热是一种能量，为了解释热能，人们使用了燃素这个概念来量化热。但是，后来人们发现摩擦生热不能用燃素来解释，于是人们慢慢认识到燃素并不存在，热能只是一种能量形式，它可以和机械能相互转化。最后人们意识到能量不仅包括机械能，势能和热能，还包括物体的化学能乃至静止质量。当今对能量的认识已经更加深入，甚至认为真空由于充满了量子涨落，所以它也是一种能量的形式，甚至这种能量很可能是导致宇宙加速膨胀的原因。所以，我们可以看到，虽然能量可以有很多表现形式，但是我们不能直观地去观察它。那么灵魂是否也是如此呢？我认为灵魂对于人体的作用和能量对于物理世界的作用很相似。灵魂虽然不能被探测，但是它每时每刻都在藉着人体产生作用。所以，与Paul Davies的观点不一样（他在和Hugh Ross的辩论中认为上帝不应该具有人那样的位格，因为上帝是超越的），我认为人的灵魂的价值远超越于物质世界的价值，人的灵魂本身就是最有价值的存在，是整个宇宙的焦点。

那么到底该如何给灵魂建立一个模型呢？按照我之前博文中所描述的，我们可以用一种类似计算机软件和硬件之间的关系来模拟灵魂和肉体的相互作用。正如软件的作用是给电脑输入命令并让电脑执行命令，同样灵魂也支配肉体并让肉体产生行动。但是这两者并不是那么独立的。正如电脑的硬件必须运转正常而且必须支持软件的语言和精度要求，同样，身体也必须拥有相应的结构和基因来容许灵魂将其支配。正如软件可以离开硬件而依然以另外的形式存在，同样灵魂也可以离开身体以另外的形式存在（比如耶稣复活之后的身体）。如果我们要用这种计算机模型来类比地模拟人的灵魂和肉体的关系，我们就必须进一步去了解灵魂是怎样储存的（如何建立在大脑的记忆中的），灵魂的语言是如何被肉体识别的（或者它的驱动和借口是什么），灵魂又是如何自我更新的（如同软件更新一样）等。记住，这里对灵魂的建模并不代表我们真正明白灵魂是什么，正如我们知道万有引力的公式并不代表我们知道引力本身是什么一样。所以，虽然我们不能彻底地明白灵魂本身是什么，但是我们可以明白它是如何运作的，如何和身体纠缠的。我们可以进一步比较这种二元论的模型（物质和灵魂）和一元论模型（只有物质）的优劣，并进而促进更多的科学研究。

第二，神用话语创造并护理整个宇宙。我觉得这个最普通的圣经原则也是最被人忽略的深刻思想。我们知道这话语是与基督联系在一起，或者说就是基督，我们也发现圣经启示万有都是本于祂，依靠祂，并归于祂。而祂就是道。所以更大胆的说，祂就是这个宇宙的灵魂，这和上一个圣经思想紧密关联。不过，我并没有深入研究基督论，若要继续探究下去，恐怕陷入异端的思想。但我要坚持的是，这个宇宙的根基在于上帝的话语，无论是它的被造，还是它现在的运行，都在于上帝的话语。这话语表现在诸多的科学研究中，比如精细调节问题，太阳系起源问题，生命起源问题，DNA信息等。而现在的量子物理最前沿的研究就是量子信息，所以，这话语很可能是借着量子系统表达出来的，因为我们已经发现了量子可以像电子一样用于计算。这种话语控制物理世界不是和人的灵魂控制身体很相似吗？这种思想并不是泛神论，因为它截然区分了信息和物质，灵魂和肉体。那么我们该如何描述上帝的话语呢？如何建立模型呢？这也是我想发展的一个研究方向。

首先，我们要识别哪种结构里面可能有上帝创世的信息。比如地球产生的初始条件中可能有上帝话语的输入。其次，我们要研究这种信息怎样地透过量子系统放大到宏观系统。量子信息只存在于量子耦合的系统中，一旦量子系统与经典系统接触，量子信息要么被抹去，要么被读取并且放大为一种初始条件（比如量子计算机运算结果的输出）。所以，研究这种信息从量子系统到经典系统的转变是问题的关键。然后，我们要知道如此微小的量子信息该如何放大到宏观乃至宇观世界。正如DNA信息可以表达出一个生命系统，同样，上帝信息如何表达出一个宇观结构呢？我觉得一个很可能的机制就是相变。只有在相变的过程中，微观的信息才可能发展成宏观的初始条件。最后，这种宏观的初始条件经过一系列的非线性过程发展出宇观的结构。当然，上帝除了可以借用量子系统来输入信息，祂也可以借用混沌现象来输入信息。动力学混沌现象就是系统的输出非常敏感于系统的输入，哪怕这种输入变动非常的微小，也会导致结果谬以千里（著名的蝴蝶效应）。

但也许你要问，为什么上帝要输入这些微观的信息，而不直接创造一个太阳系呢？我认为原因至少有两个。第一，祂要人去了解祂创造的一切，正如祂让亚当给动物命名一样。只有人去探索万物运行的原理，人才能治理万物。而如果上帝直接而且频繁地超自然地不藉着手段地介入到这个宇宙，我们就难以认识它和治理它。第二，祂要隐藏在这个罪恶的世界背后。上帝是圣洁的，所以我们在这个世界中无法察觉祂直接的干预（除非是祂用于救赎目的的神迹）。按照圣经的说法就是，我们是在死荫的幽谷中，除了圣经，没有从自然而来的特殊启示。值得注意的是，如同上帝创造时的话语可以在自然的结构中去探索以外，上帝护理的话语（即用祂权能的命令托住万有）也可以用类似的方式去了解。然而，也许我们最终并不能弄清楚上帝到底说了什么话，如同破解计算机密码一样。但是，我们需要明白的是这个宇宙肯定有信息的输入，而这种信息不是宇宙和物理定律本身所能解释的。注意，这并不是另一个“缝隙中的上帝”的论据，因为这种信息宇宙的模型本身就是基于上帝用话语创世的思想，所以，直接验证了圣经思想的真确性。于是，我们不再自下而上地去论证哪种自然现象可能是上帝做的，而是自上而下地预言哪些现象是上帝话语的宏观表现。

第三，这个宇宙是为了道成肉身的基督而存在。圣经说，万有都是本于祂，依靠祂，并且归于祂。这就表明，这个宇宙存在的终极原因是为了基督，具体而言，就是为了基督道成肉身。因为只有基督是神本体的真像，只有基督的道成肉身完美地彰显了上帝的荣耀。一旦我们知道这个宇宙的终极目的，我们就可以进一步去追问一些自然现象的终极原因，同时也为探索宇宙的运作方式提供了重要线索。正如一个建筑师在建造房屋之前会画图纸，同样上帝也按照祂的道成肉身的救恩蓝图去建造宇宙。正如我在前面一篇博文中谈到的，如果我们以道成肉身作为第一公理，我们就可能推导出为什么这个宇宙是这样子的，而不是别样的。正如莱布尼兹所言，这个宇宙是上帝所创造最好的宇宙。为什么有死亡和自然灾难呢，因为没有死亡和灾难我们不知道罪的结果，也就不明白基督受难的必要性和重要性。为什么量子世界有不确定性呢？因为道成肉身的宇宙必然是一个罪恶的世界，所以，这个罪恶的世界必然有一种机制允许上帝继续护理，但同时又不与罪人相交。我们可以运用同样的逻辑去追问更多的自然和人文现象。所以，基督的道成肉身可以称为这个宇宙的第一公理。一旦这个模型得以建立，我们不仅可以去解释宇宙现象存在的必要性，也可以去解释物理定律的必需性并建立一些模型去预言一些现象。比如我们明白死亡是道成肉身的必需，我们就可以预言科学无法解决死亡的问题，死亡根深蒂固地根植于人的身体中。这种预言虽然是负面的，但是我们可以由这种思想继续探索哪些人体的构造或者基因导致了死亡的必然性。正如爱因斯坦假设光速是恒定的，进而推导出狭义相对论；同样，我们也可以假定死亡是必然的，进而推导出生物学的定律。

第四，这个宇宙中存在某种指向天堂的结构。在上一个思想中，我们看到这个世界的构造是人犯罪的一种表现，也就是说，这个宇宙本来可以不用这样的，但是为了容许人犯罪并且基督道成肉身，这个宇宙就被造成这样了。但是这个宇宙也同样地在盼望一个更美的世界，这就是罗马书所言的，“被造之物都热切盼望，热切等待着神的儿女显现出来……我们知道，所有被造之物都一同呻吟、同受阵痛，直到如今”。是的，它们在叹息，但是它们同时也在盼望，因为上帝在第七天进入了祂的安息，而且按照圣经神学的说法，天堂一直以喻体的形式被我们认识，最开始是伊甸园，后来是约柜，后来是会幕，圣殿，最后是基督，教会，最终是荣耀的天堂，和上帝同在的地方。那么在这个宇宙中必然也设立了某种次序，这种次序让我们看到将来的荣耀。安息日很可能不只是一种上帝给人的一种任意的规定，而是上帝设立在受造之物当中的一种时间次序。也就是说，上帝设立了两种次序，一种是以七为标准的时间次序，另外一种是以地球为标准的空间次序。只有这样去设想，我们似乎才能想得明白为什么受造之物也在叹息和盼望。而且，上帝不仅让人守安息日，也让地守安息日。不仅如此，上帝也将7视为完全数。也就是说，这种次序甚至存在于数学当中。当然，这些都是需要继续研究并探索的思想。我可以设想的一个应用就是热力学第二定律。其实，热力学第二定律本身是从微观世界涌现出来的一个定律，这个定律告诉我们一切的秩序都将变为混乱无序，生命将变为死亡，但是天堂并没有热力学第二定律，否则天堂也有死亡了。那么如何克服热力学第二定律呢？麦克斯维前瞻性地提出麦克斯维妖来解决这一问题。只要有一个精灵可以探测粒子的信息而对其进行分类，那就可以克服热力学第二定律。也就是说，热力学第二定律中的熵和信息具有某种等价性，获取信息就可以阻止熵增，进而克服热力学第二定律。所以，我想上帝的话语正是克服热力学第二定律的最好选择，因为正是由于这种信息，我们才看到了结构，生命和希望。所以，基督说，祂的话就是生命，这一点也不是类比，而是事实。

我想也许有更多的圣经原则有待我们去发现和运用。神的话语不断更新我们的生命，也不断震撼我们的头脑。我们并不必去发明新的教义，而是圣灵可以藉着那古旧的启示来更新我们的生命，来拓展祂的国度。愿我们都进入那上帝的国与安息中！

和大多数古代神话不同的是，圣经的创造故事里面只有一位神，而这个独一神是从无创造出有（ex nihilo）的神。除了创世纪第一章，在圣经中其他经文中我们也可以看到对这ex nihino的创造的记载：

亚伯拉罕所信的，是那叫死人复活，使无变为有的上帝。 （罗马书4章17节）

另外一个独特之处，在我看来是上帝用祂的话语创造了宇宙万物而非其他神话中广泛使用的神与神之间的媾和，这也是Sproul B.C.（司布尔）的观点。虽然其他神话中也有用话语创造的例子（Shaw, I., and Nicholson, P., The British Museum: Dictionary of Ancient Egypt (London, 2003), p.284），但是没有一个神话是独一的上帝用祂的话语从无（即没有任何物质或能量）创造出有（物质或者能量，包括定律）。我们在其他神话中或多或少都可以找到圣经创造故事的某些影子，就如中国的女娲造人故事等，但是没有一个故事具有圣经创造故事中所有这些关键的独特性。而这种独特性对于我们理解上帝的两种启示：普遍启示和自然启示是至关重要的。

上帝的成文的特殊启示是用圣经的形式传递的，而肉身的特殊启示是透过基督显明的，这肉身的基督又是上帝创造宇宙的话语，所以自然启示并非只具有物质的实体，它还具有上帝话语的某些特点。正如诗篇19篇2节所言，“这日到那日发出言语，这夜到那夜传出知识”。这些言语和知识不仅仅只是科学研究所发现的这些定律，而且还彰显了上帝的永能和神性，以至于让人无可推诿。虽然科学研究的目的常常不是为了寻找意义，但是那些不信的科学家也在运用上帝给他们的能力去发现那些隐藏在万物背后的奥秘。而常常我们会再这些发现背后找到话语，以及这话语所承载的意义。

一个很有名的发现就是DNA双螺旋结构，只有特定类型的碱基才能配对，而不同的序列可以表达成不同的蛋白质，不同蛋白质的组合可以形成不同的器官，最终表达出一个物种出来。在这整个表达当中，DNA只是一个载体，而DNA序列才是信息。所以，生物体并非只是蛋白质的堆积（如某些还原论所言），而是信息的表达。正如我现在所使用的windows系统，它虽然是承载于我的笔记本电脑这个硬件之上的，但是更重要的乃是它是由一个具有高度组织性和目的性的程序员团队创造出来的一个信息系统。这个信息系统不是封闭的，而是开放的，它可以根据我的指令执行操作。同样，上帝的创造不仅是物质性的，更是信息的，言语的，而且这言语是透过物质表达的，不是分开的。也许有人说这信息是自然涌现出来的，就像我们观察云朵的时候也会偶尔发现一些有意思的形状，就像某些动物或者符号。但是，我们在基因世界里看到的不仅是或是或非的符号，而是一系列存于不同染色体中的DNA分子的有机并且精确的表达。这就好比计算机程序，如果出现一个小错误，或者各个部分不能按次序彼此协作运行都会出现bug，甚至死机。但是我们发现新生儿的健康出生在任何时代都是再平常不过的事情了。我在这里并非要支持“智慧设计论”的方法，但我支持他们的结论，那就是这个宇宙乃是由上帝用言语从无中创造出来的。这也是人类基因组首席科学家Francis S. Collins在他的“The Language of God”中所讲的。

那么，上帝除了用言语创造生物物种，祂还用言语创造了非生命的存在，那么这些物理的存在是否也具有某种信息呢。在我看来物理世界的信息也是很丰富的，但是这些信息需要某些复杂的手段才能呈现出来。一个很有名的信息就是宇宙学里面的里程碑式的发现：宇宙微波背景辐射（CMB）。如果你Google一下就会了解这张图的重要含义，它是由宇宙诞生后大概38万年光子（它让我们可以看见）和重子物质（它组成我们所看见的东西）脱偶后所遗留下来的辐射（或者光子；就是我们的单反相机拍照所收集的光子一样，但是波长更长，因为温度更低）。

这张图包含了许多信息，这些光子的角向分布告诉我们一些关键的宇宙学常数，比如宇宙年龄，宇宙中物质，暗物质，暗能量的密度乃至最近比较火的引力波的存在等。正如DNA分子的发现一样，这张图也是宇宙学乃至整个物理学的里程碑式的乃至偶像式的标志性信息图。我们为什么要研究它呢，因为它里面有信息。这信息不是我们赋予的，乃是上帝赋予的，而且上帝给我们能力去发现。所以这张图的发现对那些不信的科学家而言并非什么好事，因为上帝在审判的时候会用他们每天所膜拜的画作来质问他们为什么不信画的作者。耶稣再来若真的有这样的责问也并非意外，因为正是这张图告诉我们这个宇宙是一个精细调节的宇宙。也就是说，这张图不只是像我们看天上的云一样可以随意变换的，而是像DNA分子的表达一样差之毫厘谬以千里。如果改变这张图一点点，比如1亿亿分子一，以至于暗能量或者宇宙学常数改变这个量级，那么宇宙要么膨胀太快要么坍缩，星系将无法形成，我们也就无法欣赏这美丽画作了。虽然暴涨宇宙学模型通过所谓的标量场相变等等理论涂抹了某些精细调节常数，但是却引入了宇宙学常数这个更可怕的精细调节常数。不仅如此，这张图的表达也是至关重要的，这图中的有的地方亮有的地方暗意味着某些地方密度高某些地方密度低，而这些密度高的地方通过引力作用就不断坍缩最后形成星系，星系与星系并和产生如今我们所看到的星系。这些星系里面的恒星不断形成，恒星的死亡不断产生新的元素，最终形成了适合我们生存的地球。当然，要形成适合人类生存的地球并非宇宙学常数的精细调节可以做到。因为生命体的存在需要极其苛刻的条件，比如温度（日地距离），潮汐力（月亮的距离和大小适中），季节变化（地球自转轴的角度），冰河周期（地球长周期轨道变化）以及对星际环境的要求，比如太阳不能在星团里，不能有太多的小行星和彗星撞击，但也不能太少，不能接近银心，不能靠近分子云，不能在谐振带内等。总而言之，宇宙学里面的这张图和生物学里的那张图一样重要，无论是它的设计，还是它的表达都关乎到你我的性命。而在上帝的护理下，你我可以享受美好的生命，并且可以去认识祂，这真是不可思议。

最后，我还想介绍一张图，这张图可能并不为许多人所知，但是也是非常重要的，而且也是关乎我们的生死存亡，这张图也是我现在的研究课题。我要介绍的其实是一系列的周期性或者半周期性的曲线，这些曲线与曲线之间常常会有某种联系，但是这种联系又是随时间变化的。还是别卖关子了，我说的就是地球上300万年来的气候变迁。

上面这张图记录了地球轨道参数的变化（曲线1-4）所引起的地球日照的变化（曲线5）以及所产生的气候变化（最后两条曲线）。如果你仔细观察就可发现上面这张图中曲线5和后两条观测到的数据有一定的关联，也就是所地球的长周期轨道变化（如十万年）引起了气候的长周期变化。但是有时你会发现日照最大值会落后温度最大值，而且在100万年之前，气候变化以4万年周期为主，而到了100万年以后，气候变迁以10万年周期为主，而且全球气候平均而言在不断降低（不包括最近百年来的认为的气候变暖）。不仅如此，这些周期性的变化在270万年以前是没有的，只有270万年以后才有这样的周期性变化。这些周期性变化不仅出现在全球温度当中，也出现在地磁强度，宇宙线强度和二氧化碳丰度当中。虽然，现在的理论还是以地球长周期轨道的变迁来解释气候变迁，但是不可否认的是其他因素，比如宇宙线，陨石撞击，火山爆发也对气候有一定影响。例如6亿5千万年之前的恐龙灭绝已经定论为小行星或者彗星撞击。所以地球不是一个封闭系统，特别在考虑长期演化的时候。那么这些和上帝的话语有什么关系呢？我觉得大有关系。我们看到由不同的同位素或者生物沉淀物记录的曲线都有各自不同的频率，而且这些频率随时间而变。受造物生存的系统可以被视为四个系统的共同协同作用，地理系统（包括洋流，冰川，火山等），生态系统，气候系统（包括降雨，季风，温度等）以及地外系统（包括太阳活动，小行星，彗星，其他行星等）。在这些系统的协同作用下产生的冰河期和间冰期以及不同的周期，而这些时期对人类的生存是很重要的。如果没有小行星毁灭恐龙，人类及弱小哺乳动物将无法生存；如果没有冰河时期，可能某些生物不能灭绝（上帝很可能用自然的手段来毁灭某些物种），以至于不能生成新的物种，也有可能冰期的存在可以让地球的石油和煤炭储量增加来供应现代人类的需要，当然也许上帝有其他意图。在我看来，以上这些系统的相互协调，相互影响，就像不同的乐器的相互协作才产生了交响乐，同样这些系统的协作产生了气候和物种变迁，并且为人类预备了最合适的气候，生态和地理环境。

当我以圣经的世界观来观看这个世界的时候，我真地看到它的美，我也越来越享受在这样的科研当中，因为我知道我在解密上帝的语言。在我看来，物理定律，生物的机理和地球系统的变迁都是信息，这些信息承载于实体当中，为要传递知识和言语，并且目的是为了颂赞上帝的智慧和荣耀，并服务于人类的福祉。